Der Markt Winklarn ist Mitglied in den Schulverbänden Winklarn und Oberviechtach.

Die Jahrgangsstufen 1 bis 4 sind dem Schulverband Winklarn zugeordnet mit dem Schulorten Winklarn und Thanstein. Ab der Jahrgangsstufe 5 wird an der Doktor-Eisenbarth-Schule in Oberviechtach unterrichtet.

Weiterführende Schulen befinden sich in der näheren Umgebung.